Liiton toiminnan pääasiallinen rahoittaja on Raha-automaattiyhdistys.
Liitto kuuluu jäsenjärjestönä Sosiaali- ja terveysturvan keskusliittoon (STKL), Sosiaali- ja terveysjärjestöjen yhteistyöyhdistykseen (YTY), Lastensuojelun Keskusliittoon (LSKL), Terveyden edistämisen keskukseen (Tekry) sekä Suomen ICSW:hen eli sosiaalipolitiikan maailmanneuvostoon.
Suomen Kasvatus- ja perheneuvontaliiton yhteistyökumppaneina ovat erityisesti liiton henkilö- ja yhteisöjäsenet, kuntien kasvatus- ja perheneuvolat, koulu- ja sosiaalitoimen työntekijät sekä muut kasvatus- ja perheneuvontatyötä tekevät tahot.
Liitolla on ollut historiansa aikana yhteistyötä monien eri organisaatioiden kanssa. Liitto tekee aktiivisesti yhteistyötä muun muassa yliopistojen, ammattikorkeakoulujen, Terveyden ja Hyvinvoinnin laitoksen, Sosiaali- ja terveysministeriön, sosiaalialan osaamiskeskusten, eri kuntien, seurakuntien ja järjestöjen kanssa.